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上海逸峰生物科技有限公司

專家是如何富集低豐度蛋白的(一)

時(shí)間:2010-12-21閱讀:959
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 鑒定與疾病相關(guān)聯(lián)的蛋白難度頗高,因?yàn)闃悠分械纳贁?shù)幾種高豐度蛋白在總蛋白中占了很大的比例。以臨床研究中常用的血清和血漿為例,蛋白濃度范圍跨越了11個(gè)數(shù)量級(jí)。而且,20種zui高豐度的蛋白占據(jù)了總蛋白量的97-99%。如此一來,有價(jià)值的生物標(biāo)志物就變得難以尋覓了。

如何打倒高豐度蛋白這個(gè)巨人,發(fā)現(xiàn)其身后躲藏的低豐度蛋白呢?Bio-Rad公司開發(fā)出ProteoMiner蛋白富集技術(shù),能夠降低高豐度蛋白的水平,助您發(fā)現(xiàn)低豐度蛋白的秘密。關(guān)于此項(xiàng)技術(shù),生物通之前曾做過詳細(xì)報(bào)道,請(qǐng)看《揭開低豐度蛋白的秘密》這篇文章。如今,這項(xiàng)技術(shù)已經(jīng)走向,應(yīng)用在多個(gè)蛋白質(zhì)組學(xué)實(shí)驗(yàn)室中。這一次,Bio-Rad公司請(qǐng)來三位蛋白質(zhì)組學(xué)方面的專家,談?wù)勊麄兪侨绾螒?yīng)用ProteoMiner技術(shù)的。

 

 

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Stefan Lehr博士(德國)——發(fā)現(xiàn)糖尿病診斷的生物標(biāo)志物

德國糖尿病中心30多年來一直將的技術(shù)、研究行動(dòng)與病人關(guān)懷融合,以求闡明疾病的方方面面。他們的目標(biāo)是:了解疾病的生理機(jī)制,減少糖尿病相關(guān)的并發(fā)癥,并改善患者的治療。

正是這種從基礎(chǔ)研究到臨床應(yīng)用的轉(zhuǎn)化,吸引了Stefan Lehr博士在獲得博士學(xué)位之后加入了該中心。Lehr的研究生階段是在科隆大學(xué)度過的,他的研究方向是信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)和胰島素受體的磷酸化。經(jīng)過多年的鍛煉,他對(duì)質(zhì)譜、2-D電泳以及亞細(xì)胞分部等復(fù)雜的實(shí)驗(yàn)室技術(shù)非常精通。Lehr認(rèn)識(shí)到II型糖尿病是一種發(fā)病率逐年提高的疾病,于是他建立了一個(gè)蛋白質(zhì)組學(xué)實(shí)驗(yàn)室。

如今,Lehr仍然在使用技術(shù)來分析與II型糖尿病相關(guān)的蛋白模式。研究的一個(gè)方面是分析人類血清樣本,以了解疾病的分子發(fā)病機(jī)理。在使用2-D差異凝膠電泳時(shí),他面臨的干擾也是高豐度蛋白。“大的斑點(diǎn)遮蔽了小的斑點(diǎn)。傳統(tǒng)方法需要好幾步,有時(shí)可能會(huì)丟失蛋白,”Lehr認(rèn)為。

這個(gè)挑戰(zhàn)激發(fā)了Lehr對(duì)Bio-Rad ProteoMiner蛋白富集技術(shù)的興趣。之后,Lehr就開始用人類血清來檢驗(yàn)這項(xiàng)技術(shù)。初期檢測(cè)表明人類血清也能進(jìn)行蛋白質(zhì)圖譜分析。隨后,研究小組設(shè)計(jì)實(shí)驗(yàn),來評(píng)估重復(fù)性和變異性,以及與下游方法的兼容性。Lehr強(qiáng)調(diào)關(guān)鍵是在重復(fù)性。

隨著驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)的成功完成,Lehr計(jì)劃將ProteoMiner蛋白富集技術(shù)融入他的流程之中,作為低豐度蛋白的一步分部法。他希望由此鑒定出II型糖尿病早期階段的生物標(biāo)志物。糖尿病的診斷通常是在發(fā)作幾年后。Lehr希望疾病的早期診斷能夠預(yù)防相關(guān)的并發(fā)癥,比如心肌梗塞和中風(fēng),并顯著降低治療的費(fèi)用。來源:生物通

 

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