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上海裕臣生物科技有限公司

Science:癌癥基因數(shù)據(jù)提出技術(shù)質(zhì)疑

時(shí)間:2012-11-5閱讀:449
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據(jù)美國(guó)國(guó)立癌癥研究所的一位病理學(xué)家David Levens稱(chēng),在PubMed數(shù)據(jù)目錄上有超過(guò)25,000篇關(guān)于Myc基因的論文,這種基因與轉(zhuǎn)移性癌癥有關(guān),但是現(xiàn)在由于一項(xiàng)研究成果,因此都需要重新再評(píng)估,這項(xiàng)研究指出了Myc的致癌作用比大多數(shù)人認(rèn)為的都要更廣泛,而目前的實(shí)驗(yàn)方法具有缺陷,也許會(huì)造成Myc研究倒退十年。

MYC有助于細(xì)胞活化,在這一過(guò)程中細(xì)胞快速成熟并分裂。例如在一種免疫應(yīng)答過(guò)程中,白細(xì)胞被激活幫助對(duì)抗感染。如果激活沒(méi)有得到適當(dāng)?shù)卣{(diào)控,那么細(xì)胞就會(huì)失控生長(zhǎng)導(dǎo)致癌癥。研究人員已經(jīng)知道異常高水平的MYC可以導(dǎo)致癌癥,但直到現(xiàn)在也沒(méi)有人能夠解釋它是如何導(dǎo)致如此多不同種類(lèi)的癌癥的。
研究人員在實(shí)驗(yàn)室培養(yǎng)皿中追蹤白細(xì)胞中的MYC,他們選擇了白細(xì)胞、確切地說(shuō)是對(duì)抗感染的B細(xì)胞和T細(xì)胞,因?yàn)樗鼈兘?jīng)常受到異常MYC的影響,可以轉(zhuǎn)變?yōu)榱馨土龊凸撬枇黾?xì)胞。結(jié)果他們發(fā)現(xiàn)MYC并沒(méi)有偏愛(ài)任何特定的基因類(lèi)型。反而,MYC蛋白存在于已經(jīng)表達(dá)或開(kāi)啟的幾乎所有基因上,而且基因越是活躍,便有越多的MYC聚集在那里。MYC似乎擴(kuò)大了相對(duì)初始表達(dá)水平的產(chǎn)率,小幅度增強(qiáng)了低活性的基因,大幅度增強(qiáng)了高活性的基因。

文章作者認(rèn)為這項(xiàng)研究成果“概況了他們過(guò)去五年間所許多的各種關(guān)鍵概念”,研究組分析了幾乎所有的基因表達(dá)研究結(jié)果,這是一項(xiàng)不可能完成的任務(wù),因?yàn)檫@種方法已經(jīng)在整個(gè)生物學(xué)研究領(lǐng)域獲得了廣泛應(yīng)用,在一個(gè)公共數(shù)據(jù)庫(kù)里就有超過(guò)750,000個(gè)基因表達(dá)數(shù)據(jù)。

Levens和另外一位參與研究的分子生物學(xué)家:Richard Young一年前就開(kāi)始嘗試更好的解釋突變Myc如何促發(fā)癌癥的,由于他們的努力,196年諾貝爾生理/醫(yī)學(xué)獎(jiǎng)得主James Watson敦促2011年召開(kāi)了Myc會(huì)議。
就是在這個(gè)會(huì)議上,Levens“恐嚇性的”提出了致癌因子Myc并不會(huì)如這許多年大家認(rèn)為的,激活特異性基因,而是一種“通過(guò)細(xì)胞中所有基因表達(dá),提高RNA轉(zhuǎn)錄的通用性開(kāi)關(guān)”,有兩項(xiàng)各自獨(dú)立的研究證明了這一點(diǎn)。而研究則證明了這種通用性基因活化比想象的更為常見(jiàn)。

當(dāng)然并未所有人都贊同這一觀(guān)點(diǎn),賓州大學(xué)Abramson癌癥中心的主任,Myc研究專(zhuān)家Chi Van Dang認(rèn)為有些相關(guān)報(bào)道被夸大了,他尤其反對(duì)Levens用“普遍”來(lái)形容Myc促進(jìn)基因RNA轉(zhuǎn)錄,在Dang看來(lái),至少有10%受到致癌基因影響的基因被抑制了。而來(lái)自Broad研究院的癌癥研究人員Todd Golub則認(rèn)為,從更廣泛的議題上來(lái)說(shuō),認(rèn)為“所有之前報(bào)道的基因表達(dá)研究都受到懷疑”這是錯(cuò)誤的。
也有科學(xué)家站在Levens這一邊,來(lái)自加州Buck研究所的分子生物學(xué)家Simon Melov表示,他常和其他人說(shuō)“文獻(xiàn)中80%的表達(dá)研究都不可信”,因?yàn)閷?shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)不合理。而Young和 Levens提到的這一具體問(wèn)題——各個(gè)細(xì)胞中基因表達(dá)差異大,RNA分析需要規(guī)范化——其實(shí)是“顯而易見(jiàn)”的,Melov說(shuō)。

來(lái)源:生物通

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